L’effort mondial visant à cartographier les génomes de toutes les plantes, animaux, champignons et autres formes de vie microbienne connues entre dans une nouvelle phase, passant des projets pilotes au séquençage à grande échelle. Cette nouvelle phase du projet « Biogénome de la Terre » (EBP) est marquée par une série d’articles publiés dans le dernier numéro des « Proceedings of the National Academy of Sciences », qui décrivent les objectifs du projet, les résultats obtenus à ce jour et les prochaines étapes.
L’essence de l’EBP est qu’il s’agit du plus grand effort concerté de l’histoire de la biologie », a déclaré Harris Levin, président du groupe de travail EBP et professeur distingué d’évolution et d’écologie à l’université de Californie, à Davis. Elle va de la science fondamentale à des applications révolutionnaires qui répondent à toute une série de problèmes mondiaux urgents, tels que la prévention de la perte de biodiversité et l’adaptation des cultures alimentaires au changement climatique. » En outre, elle met « à portée de main l’objectif ultime du séquençage de tous les eucaryotes ».
Lancé en novembre 2018, l’EBP vise à fournir un catalogue complet des séquences d’ADN des 1,8 million d’espèces végétales, animales et fongiques nommées, ainsi que des eucaryotes unicellulaires.
Si aucune mesure n’est prise pour freiner le changement climatique et protéger la santé des écosystèmes mondiaux, la planète devrait perdre 50 % de sa biodiversité d’ici la fin du siècle. La création d’une bibliothèque numérique des séquences d’ADN de tous les eucaryotes connus contribuera à fournir des outils efficaces pour prévenir la perte de biodiversité et la propagation des agents pathogènes, surveiller et protéger les écosystèmes, et améliorer les services écosystémiques.
D’ici 2023, la première phase de l’EBP vise à générer des génomes de référence représentant quelque 9 400 familles taxonomiques. À ce jour, le projet affilié a généré environ 200 de ces génomes de référence, et plus de 3 000 devraient être séquencés, assemblés et annotés d’ici à la fin de 2022, ce qui représente environ un tiers de l’objectif de la phase 1.
Le projet couvre le California Conservation Genome Project (États-Unis), le Darwin Tree of Life Project (Royaume-Uni et Irlande), le Vertebrate Genome Project et le 10 000 Bird Genomes Project.
En décembre 2021, les projets EBP comptent 5 000 scientifiques et techniciens de 44 institutions membres dans 22 pays sur tous les continents, à l’exception de l’Antarctique. 49 projets affiliés couvrent la plupart des principaux taxons eucaryotes, et ces projets ont accès à des dizaines de milliers d’échantillons de haute qualité provenant de collections de musées et de biologistes de terrain. Le projet BIOSCAN, qui vise à découvrir et à identifier des espèces à l’aide de techniques de codage à barres de l’ADN, et le projet Global Virus Group, qui travaille à la découverte de nouveaux virus susceptibles de constituer une menace de pandémie, font également partie des affiliés.
